Различия кардинальные! Совершенно разные двигатели! Разное все - ШПГ, ГРМ, КШМ... НАсколько я помню, взаимозаменяемых деталей по нутрянке точно нет, навеска разве что карбюратор и генератор. Системы зажигания тоже разные.
Кури интернет и клуб ТКМ (не сочтите за рекламу) moskvich-tuning.ru - там должна быть тема про различия двигателей.