Возможно, ослабла цепь ГРМ или вообще перескочила, и клапан теперь стучит об поршень, стоит проверить метки шестерни ГРМ и совпадение метки на приливе у шкива. Если всё на своих местах, тогда остаются возможные места стука только: люфт пальца в поршне, люфт шатуна или со стороны пальца, или со стороны шейки КВ. А, ну еще из возможного-невероятного частично вываливается седло клапана из головы, и может быть стук, или в направляющей клапана огромная выработка, и за счет смещения оси клапан бьет по седлу, ну или поршень лопнул. А так больше в области второго цилиндра стучать нечему.