При изношенной внутренней части подшипника и самой ступицы, у меня наблюдался эффект самооткручивающейся гайки шруса(не была закантована), тоже были вибрации. Но у меня выработка на ступице была большая, новый подшипник убило за пару тыс. км, поэтому откручивания гайки может и не происходить, особенно если она законтрена. Проверьте затяг гаек шруса, если есть ходя затяга, скорее всего ступица уже имеет износ.
P.S. Автор, а вы проверяли биение самих дисков гвоздиком?