1. Можно. ГБЦ можно менять, можно оставить, сильно принципиальной разницы не будет (хотя на эту тему сейчас начнутся споры). Коллектор впускной оставлять 331-й, 412-й под капот 41-го не влезет.
2. Смотря откуда на конкретно взятой машине сделан отбор жидкости на печку. По идее, на 331-х моторах отбор был с блока, а так как блок остается родной, то переделывать не нужно. Если отбор с ГБЦ, то либо оставляете свою ГБЦ и ничего не переделываете, либо переставляете штуцер на 412-ю ГБЦ, либо делаете отбор с блока.
3. Гильзы все одинаковые, надо смотреть, какой именно блок - 331-е блоки были и с кольцами, и без.